本所的昆蟲標本蒐藏早自日據時代便已開始,其中不乏珍貴稀有的種類,例如:大樺斑蝶、大紫斑蝶等,現今已經滅絕的種類,這些標本已為 森林資源保育以及森林害蟲防治等工作奠定堅實的基礎。 目前本所館藏的昆蟲乾燥標本已超過十八萬二千份,以鱗翅目最多(接近十二萬份),其次為膜翅目(一萬五千餘份)、鞘翅目(一萬餘份)、半翅目各二千六百餘份、蜻蛉目與直翅目各一千多份、囓目一百多份、其它昆蟲五百多份;每年大約增加二千份標本,並已納入標本櫃/ 標本箱/標本盒之系統,所有標本之蟲籤規格化。
目前已鑑定標本總計254 科1889 屬3420 種